广西南能昌菱清洁能源有限公司由南方电网综合能源广西有限公司牵头,与广西农垦糖业集团昌菱制糖有限公司、广西祥华能源投资有限公司共同出资,于2014年6月6日正式注册成立。公司注册资本为人民币500万元,南方电网综合能源广西有限公司持股51%,广西农垦糖业集团昌菱制糖有限公司持股25%,广西祥华能源投资有限公司持股24%。公司纳入南方电网管理序列。
南方电网综合能源广西有限公司是南方电网综合能源有限公司的全资子公司。广西农垦糖业集团昌菱制糖有限公司是广西农垦糖业集团股份有限公司的全资子公司。广西祥华能源投资有限公司是一家致力于可再生新能源项目投资与管理、新能源发电项目的技术服务及咨询、规划、运营、维护、管理的专业性投资公司。